Composition, propriétés et devenir des substances exopolymériques (EPS) dans les environnements sédimentaires

Thibault Duteil, chercheur en géomicrobiologie, université d’Umeå, Suède

lundi 9 mars 2026 à 13 heures salle 303

Dans les environnements naturels, la plupart des micro-organismes (algues et bactéries) vivent fixés à une surface sous forme de biofilm, une stratégie universelle de survie. Le biofilm est un agrégat organisé de micro-organismes, dans une matrice autoproduite de substances exopolymériques extracellulaires (EPS). Les EPS sont composées d’un mélange de protéines, de polysaccharides, de lipides, d’acides nucléiques et d’autres composés organiques. Elles jouent plusieurs rôles importants pour la communauté microbienne au sein du biofilm tels que : l’adhérence au substrat, l’agrégation des cellules, la rétention d’eau, le piégeage de molécules, la ressource nutritive, l’échange d’informations au sein de la matrice, ainsi que la fonction de barrière protectrice contre les polluants et les antimicrobiens. En plus de ces fonctions biologiques, ces molécules sont de plus en plus suspectées d’avoir des impacts sur les processus sédimentaires. Mes travaux sur les biofilms à diatomées de l’estuaire de la Gironde ont montré que la présence d’EPS impacte la sédimentation. Leur préservation en profondeur dans les sédiments a été analysée et mise en parallèle avec le profil géochimique d’une carotte sédimentaire estuarienne. Enfin mes recherches plus récentes montrent que les activités anthropiques changent la production et la chimie des EPS de biofilms bactériens de rivière.

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titre:

Composition, propriétés et devenir des substances exopolymériques (EPS) dans les environnements sédimentaires

intervenant:

Thibault Duteil

date:

lundi 9 mars 2026

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Composition, propriétés et devenir des substances exopolymériques (EPS) dans les environnements sédimentaires

Thibault Duteil, chercheur en géomicrobiologie, université d'Umeå, Suède

lundi 9 mars 2026 à 13 heures salle 303

 

Dans les environnements naturels, la plupart des micro-organismes (algues et bactéries) vivent fixés à une surface sous forme de biofilm, une stratégie universelle de survie. Le biofilm est un agrégat organisé de micro-organismes, dans une matrice autoproduite de substances exopolymériques extracellulaires (EPS). Les EPS sont composées d'un mélange de protéines, de polysaccharides, de lipides, d'acides nucléiques et d'autres composés organiques. Elles jouent plusieurs rôles importants pour la communauté microbienne au sein du biofilm tels que : l'adhérence au substrat, l'agrégation des cellules, la rétention d'eau, le piégeage de molécules, la ressource nutritive, l'échange d'informations au sein de la matrice, ainsi que la fonction de barrière protectrice contre les polluants et les antimicrobiens. En plus de ces fonctions biologiques, ces molécules sont de plus en plus suspectées d’avoir des impacts sur les processus sédimentaires. Mes travaux sur les biofilms à diatomées de l’estuaire de la Gironde ont montré que la présence d’EPS impacte la sédimentation. Leur préservation en profondeur dans les sédiments a été analysée et mise en parallèle avec le profil géochimique d’une carotte sédimentaire estuarienne. Enfin mes recherches plus récentes montrent que les activités anthropiques changent la production et la chimie des EPS de biofilms bactériens de rivière.